Kafka Hibino, 32 ans, nourrit l’ambition de rejoindre les Forces de Défense pour combattre les Kaijus, d’immenses bêtes destructrices qui apparaissent soudainement, anéantissant villes et vies. Après plusieurs tentatives infructueuses aux examens d’entrée de la fameuse escouade, Hibino se retrouve à travailler au nettoyage des restes de ces monstres. Sa vie prend un tournant inattendu lorsqu’il est attaqué par un Kaiju qui fusionne avec lui, le transformant en un être hybride, mi-homme mi-monstre.

Cette transformation surprenante lui ouvre les portes de l’unité de défense, lui permettant de réaliser son rêve de lutter aux côtés de Mina Ashiro, son amie d’enfance. Découvrant en lui une force nouvelle, Hibino se révèle être l’une des entités les plus redoutables, connu sous le nom de Kaiju N°8.